前言
土壤鹽堿化已成為與人類生產(chǎn)活動相關(guān)的全球性問題。在高鹽條件下，植物的光合作用、呼吸和離子運輸?shù)却x活動受到很大影響，導(dǎo)致生長遲緩、產(chǎn)量下降甚至死亡。在工業(yè)發(fā)酵過程中，通常需要向反應(yīng)器中添加高濃度的糖或礦物質(zhì)，在此過程中微生物容易發(fā)生高滲脅迫，導(dǎo)致生長和生產(chǎn)力降低。因此，如何提高生物體對惡劣環(huán)境的耐受性成為工業(yè)生產(chǎn)活動中的關(guān)鍵問題。傳統(tǒng)微生物的適應(yīng)性進化通常將微生物置于具有特殊條件的培養(yǎng)環(huán)境中（如特殊底物、高滲透壓、pH值等環(huán)境），依靠研究人員反復(fù)挑選生長較快的微生物，但存在時效性差、工作量大的問題，馴化效果往往也不盡人意。 天木生物全自動微生物適應(yīng)性進化儀（Automatic microbial adaptive evolution instrument，EVOL cell）是基于高氣體透過性微管路及單相微流控技術(shù)開發(fā)而成的微生物馴化裝備，具有微生物培養(yǎng)、傳代、化學(xué)因子梯度添加、實時檢測、氧分壓控制等功能，能夠應(yīng)用于多種微生物的培養(yǎng)和適應(yīng)性進化。
實驗過程
本案例使用天木生物全自動微生物適應(yīng)性進化儀為基礎(chǔ)開展耐NaCl大腸桿菌的馴化實驗?；罨蟮拇竽c桿菌按照2%的接種量接入新鮮培養(yǎng)基，并將其中8 mL接入耗材盒緩沖瓶。制備的無菌LB培養(yǎng)基（含1% NaCl）和高鹽LB培養(yǎng)基（含5% NaCl）用于EVOL cell根據(jù)傳代參數(shù)自動調(diào)整NaCl的添加比例。本實驗中NaCl設(shè)定為1%、1.3%、1.7%、2.0%、2.2%，2.4%，根據(jù)菌株生長情況調(diào)整每個梯度傳代次數(shù)。定期觀察設(shè)備運行情況，并且及時取樣進行菌株性能驗證及優(yōu)良菌株保藏。實驗結(jié)果
以1%NaCl作為菌株耐NaCl馴化的初始濃度，馴化總時長280 h，全自動完成傳代27次，在NaCl濃度達到2.4%時取出菌株，在搖瓶培養(yǎng)體系中比較馴化前后菌株對NaCl的耐受能力。原始菌株和耐受菌株分別在含2%和2.4%NaCl的培養(yǎng)基中進行搖瓶培養(yǎng)，結(jié)果如圖2B所示。經(jīng)過EVOL cell馴化后的菌株，在高NaCl濃度的培養(yǎng)基中，其生長情況優(yōu)于原始菌株。在2%的搖瓶培養(yǎng)10 h后，原始菌株和耐受菌株OD值分別達到1.74和2.21，生長性能提升27.01%。在2.4%的搖瓶培養(yǎng)10 h后，原始菌株和耐受菌株OD值分別達到1.43和2.09，生長性能提升46.15%。
圖2 EVOL cell耐高NaCl大腸桿菌適應(yīng)性進化結(jié)果。（A）大腸桿菌耐NaCl適應(yīng)性進化過程；（B）原始菌株與耐受菌株在搖瓶中的生長情況對比。
結(jié)論
本案例以大腸桿菌為研究對象，使用EVOL cell對其耐受NaCl性能進行適應(yīng)性進化，以提升該菌株在較高濃度NaCl環(huán)境脅迫下的生長能力。經(jīng)過280 h 27輪的連續(xù)自動傳代進化，大腸桿菌在高NaCl濃度的培養(yǎng)基中具有穩(wěn)定的生長性能，對NaCl的耐受能力提升27.01~46.15%，這說明EVOL cell在菌種改良工作中的重要作用。全自動的微生物適應(yīng)性進化儀極大提升馴化工作的自動化程度，減少實驗中的人為操作失誤造成的誤差。實時檢測能力也有助于研究人員掌握菌株生長情況，及時調(diào)整適應(yīng)性進化策略，成為實驗室及工業(yè)生產(chǎn)中微生物適應(yīng)性進化培養(yǎng)的未來趨勢。
前言
土壤鹽堿化已成為與人類生產(chǎn)活動相關(guān)的全球性問題。在高鹽條件下，植物的光合作用、呼吸和離子運輸?shù)却x活動受到很大影響，導(dǎo)致生長遲緩、產(chǎn)量下降甚至死亡。在工業(yè)發(fā)酵過程中，通常需要向反應(yīng)器中添加高濃度的糖或礦物質(zhì)，在此過程中微生物容易發(fā)生高滲脅迫，導(dǎo)致生長和生產(chǎn)力降低。因此，如何提高生物體對惡劣環(huán)境的耐受性成為工業(yè)生產(chǎn)活動中的關(guān)鍵問題。傳統(tǒng)微生物的適應(yīng)性進化通常將微生物置于具有特殊條件的培養(yǎng)環(huán)境中（如特殊底物、高滲透壓、pH值等環(huán)境），依靠研究人員反復(fù)挑選生長較快的微生物，但存在時效性差、工作量大的問題，馴化效果往往也不盡人意。 天木生物全自動微生物適應(yīng)性進化儀（Automatic microbial adaptive evolution instrument，EVOL cell）是基于高氣體透過性微管路及單相微流控技術(shù)開發(fā)而成的微生物馴化裝備，具有微生物培養(yǎng)、傳代、化學(xué)因子梯度添加、實時檢測、氧分壓控制等功能，能夠應(yīng)用于多種微生物的培養(yǎng)和適應(yīng)性進化。
實驗過程
本案例使用天木生物全自動微生物適應(yīng)性進化儀為基礎(chǔ)開展耐NaCl大腸桿菌的馴化實驗?；罨蟮拇竽c桿菌按照2%的接種量接入新鮮培養(yǎng)基，并將其中8 mL接入耗材盒緩沖瓶。制備的無菌LB培養(yǎng)基（含1% NaCl）和高鹽LB培養(yǎng)基（含5% NaCl）用于EVOL cell根據(jù)傳代參數(shù)自動調(diào)整NaCl的添加比例。本實驗中NaCl設(shè)定為1%、1.3%、1.7%、2.0%、2.2%，2.4%，根據(jù)菌株生長情況調(diào)整每個梯度傳代次數(shù)。定期觀察設(shè)備運行情況，并且及時取樣進行菌株性能驗證及優(yōu)良菌株保藏。實驗結(jié)果
以1%NaCl作為菌株耐NaCl馴化的初始濃度，馴化總時長280 h，全自動完成傳代27次，在NaCl濃度達到2.4%時取出菌株，在搖瓶培養(yǎng)體系中比較馴化前后菌株對NaCl的耐受能力。原始菌株和耐受菌株分別在含2%和2.4%NaCl的培養(yǎng)基中進行搖瓶培養(yǎng)，結(jié)果如圖2B所示。經(jīng)過EVOL cell馴化后的菌株，在高NaCl濃度的培養(yǎng)基中，其生長情況優(yōu)于原始菌株。在2%的搖瓶培養(yǎng)10 h后，原始菌株和耐受菌株OD值分別達到1.74和2.21，生長性能提升27.01%。在2.4%的搖瓶培養(yǎng)10 h后，原始菌株和耐受菌株OD值分別達到1.43和2.09，生長性能提升46.15%。
圖2 EVOL cell耐高NaCl大腸桿菌適應(yīng)性進化結(jié)果。（A）大腸桿菌耐NaCl適應(yīng)性進化過程；（B）原始菌株與耐受菌株在搖瓶中的生長情況對比。
結(jié)論
本案例以大腸桿菌為研究對象，使用EVOL cell對其耐受NaCl性能進行適應(yīng)性進化，以提升該菌株在較高濃度NaCl環(huán)境脅迫下的生長能力。經(jīng)過280 h 27輪的連續(xù)自動傳代進化，大腸桿菌在高NaCl濃度的培養(yǎng)基中具有穩(wěn)定的生長性能，對NaCl的耐受能力提升27.01~46.15%，這說明EVOL cell在菌種改良工作中的重要作用。全自動的微生物適應(yīng)性進化儀極大提升馴化工作的自動化程度，減少實驗中的人為操作失誤造成的誤差。實時檢測能力也有助于研究人員掌握菌株生長情況，及時調(diào)整適應(yīng)性進化策略，成為實驗室及工業(yè)生產(chǎn)中微生物適應(yīng)性進化培養(yǎng)的未來趨勢。
